Теперь команды из 54 исследовательских групп, во главе с университетов Эдинбурга (Великобритания), Иллинойс (США), Упсала (Швеция) и Вагенинген (Нидерланды) последовательность всего генома свиньи. Результаты были опубликованы одновременно в множестве статей в Nature, Труды Национальной академии наук и других престижных журналах в середине ноября. 

Ученые сравнили геном домашней свиньи с теми, диких кабанов и других «предков» из разных уголков Европы и Азии. Они также сравнили геном свиньи с человеческим, корова, собака, лошадь и мышь геномов.

Результаты показывают, что общий размер генома свиньи составляет 2,8 млрд. пар оснований и содержит 21640 белок-кодирующих генов. Это похоже на других млекопитающих, включая человека. Интересно, что изменения в геноме свиньи, даже в коммерческих пород, более чем в два раза, что в организме человека.

Геном последовательности данных из диких свиней указали, что они возникли в Юго-Восточной Азии около четырех миллионов лет назад. Исследования обнаружили значительные генетические различия между кабана из Азии и Европы, в результате их отделения от общего предка около миллиона лет назад. Европейских и азиатских популяциях затем потерял значительное количество генетического разнообразия около 20.000 лет назад, вероятно, в результате глобального похолодания во время последнего «Ледникового периода». Различия между двумя популяциями, отражены в генах текущего дня западные и китайские породы домашних свиней, подтверждающие, что свиньи были независимо одомашнены в Западной Евразии и Восточной Азии около 10000 лет назад. Тем не менее, в течение последних 300 лет произошло интрогрессии из азиатских генотипов в Европейский генотипов. Основываясь на последних данных секвенирования, по оценкам, около 35% коммерческих генома свиньи сегодня, в значительной степени основаны на европейских генов, можно проследить на азиатских пород.

М. Groenen, 2008

Одомашнивание привело к значительным изменениям в целый ряд признаков. Они включают в себя поведенческие характеристики, репродуктивной функции, размер тела и форма, и цвет кожи. Например, в результате одомашнивания свиньи становятся все длиннее, как отметил Чарльз Дарвин, который подробно рассказал в своей книге 1868 «Изменение животных и растений под одомашнивание». В принципе, свиней стало больше, потому что свинья хранители выбраны животные с большим числом позвонков. Тем не менее, мы теперь понимаем, что три различных генов, вовлеченных - NR6A1, PLAG1 и LCORL которой все происходящие в европейских кабанов.

Некоторые генов групп, таких как иммунная и обонятельные гены, которые более эволюционно развивались в свинью, чем у человека и многих других животных. В самом деле, свиньи имеют очень развито обоняние, которое позволяет им быть использован для поиска трюфелей, и наибольшее количество активных генов обоняния признание всех животных, которые подверглись геномных последовательностей на сегодняшний день, в том числе собак. С другой стороны, свиньи имеют меньше генов вкус, что позволяет им принимать пищу, что люди будут отвергать, таких как отходы и отходы. Они имеют высокую устойчивость к соли и горькие вещества и различное восприятие сладкого вкуса и мясистые продукты питания по сравнению с людьми.

Другие исследования подтвердили пригодность свиней в раскрытии генетики человеческих заболеваний. В общей сложности было 112 ДНК позиции, где свиной белок имеет ту же аминокислоту, которая была вовлечена в целый ряд заболеваний, включая болезнь Альцгеймера, диабет, ожирение и болезни Паркинсона. Кроме того, данные показывают, что свиньи имеют в два раза больше генов интерферона, как и люди, возможно, дает высокий иммунный ответ против вирусной инфекции. Наконец, есть меньше эндогенных ретровирусов у свиней, чем в большинстве других животных поддержку пригодности свиней для пересадки орган исследования.

Таким образом, в дополнение к улучшению наших общих знаний о свинье, различные новые анализы генома свиньи имеют важное значение для промышленного производства свиней. Они помогут определить генетические механизмы, которые позволят улучшения общей эффективности, снижение издержек производства, повышение качества и улучшение устойчивость к болезням / сопротивления. Будущие селекционные программы смогут использовать новые знания с помощью как традиционных, так и выбор геномной селекции.Последний будет обсуждаться в дальнейших статьях.